Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QL3Q5VWW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms