Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLIPQ5VWP3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLIPQ5VWP3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLIPQ5VWP3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms