Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PERM1Q5SV97 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PERM1Q5SV97 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PERM1Q5SV97 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PERM1Q5SV97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms