Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47A1Q5JQC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47A1Q5JQC4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms