Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A4Q53GD3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC44A4Q53GD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms