Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVEP1Q4LDE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVEP1Q4LDE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVEP1Q4LDE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms