Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCGF3Q3KNV8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF3Q3KNV8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms