Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C15orf59Q2T9L4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C15orf59Q2T9L4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C15orf59Q2T9L4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C15orf59Q2T9L4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms