Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2D7

TBC1D28, TBC1 domain family member 28, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D28Q2M2D7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TBC1D28Q2M2D7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBC1D28Q2M2D7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBC1D28Q2M2D7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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