Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTF1Q16619 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTF1Q16619 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTF1Q16619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTF1Q16619 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTF1Q16619 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTF1Q16619 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTF1Q16619 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTF1Q16619 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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