Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX1Q13596 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX1Q13596 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX1Q13596 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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