Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DSG1Q02413 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSG1Q02413 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSG1Q02413 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms