Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A1P68400 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A1P68400 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK2A1P68400 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2A1P68400 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms