Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS1P54277 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS1P54277 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS1P54277 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS1P54277 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PMS1P54277 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PMS1P54277 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS1P54277 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS1P54277 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS1P54277 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS1P54277 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS1P54277 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMS1P54277 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMS1P54277 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMS1P54277 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PMS1P54277 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PMS1P54277 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PMS1P54277 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMS1P54277 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PMS1P54277 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMS1P54277 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMS1P54277 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMS1P54277 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMS1P54277 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMS1P54277 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMS1P54277 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMS1P54277 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS1P54277 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS1P54277 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS1P54277 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS1P54277 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS1P54277 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PMS1P54277 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS1P54277 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS1P54277 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMS1P54277 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMS1P54277 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PMS1P54277 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMS1P54277 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS1P54277 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS1P54277 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS1P54277 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS1P54277 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMS1P54277 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMS1P54277 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMS1P54277 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMS1P54277 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PMS1P54277 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS1P54277 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS1P54277 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS1P54277 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS1P54277 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS1P54277 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS1P54277 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMS1P54277 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMS1P54277 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS1P54277 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS1P54277 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS1P54277 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS1P54277 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS1P54277 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms