Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP5P51878 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP5P51878 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP5P51878 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP5P51878 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP5P51878 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP5P51878 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP5P51878 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP5P51878 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP5P51878 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP5P51878 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP5P51878 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP5P51878 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP5P51878 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP5P51878 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP5P51878 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP5P51878 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP5P51878 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CASP5P51878 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CASP5P51878 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP5P51878 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP5P51878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP5P51878 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP5P51878 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP5P51878 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP5P51878 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP5P51878 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP5P51878 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP5P51878 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP5P51878 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP5P51878 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP5P51878 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP5P51878 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP5P51878 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP5P51878 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP5P51878 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP5P51878 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP5P51878 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP5P51878 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP5P51878 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP5P51878 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP5P51878 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP5P51878 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP5P51878 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP5P51878 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP5P51878 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP5P51878 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP5P51878 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP5P51878 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP5P51878 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP5P51878 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP5P51878 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP5P51878 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP5P51878 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP5P51878 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP5P51878 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP5P51878 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP5P51878 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP5P51878 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP5P51878 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP5P51878 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP5P51878 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP5P51878 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP5P51878 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP5P51878 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms