Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKN1CP49918 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKN1CP49918 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms