Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM4SF4P48230 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TM4SF4P48230 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF4P48230 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF4P48230 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms