Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR4P46093 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR4P46093 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR4P46093 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR4P46093 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR4P46093 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR4P46093 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR4P46093 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR4P46093 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR4P46093 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR4P46093 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR4P46093 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR4P46093 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR4P46093 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR4P46093 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR4P46093 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR4P46093 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR4P46093 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR4P46093 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR4P46093 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR4P46093 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR4P46093 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR4P46093 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR4P46093 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR4P46093 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR4P46093 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR4P46093 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR4P46093 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR4P46093 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR4P46093 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR4P46093 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR4P46093 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR4P46093 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR4P46093 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR4P46093 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR4P46093 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR4P46093 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR4P46093 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR4P46093 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR4P46093 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR4P46093 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR4P46093 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR4P46093 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR4P46093 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR4P46093 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR4P46093 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR4P46093 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR4P46093 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR4P46093 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR4P46093 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms