Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3P39023 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3P39023 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3P39023 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3P39023 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3P39023 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL3P39023 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3P39023 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3P39023 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3P39023 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3P39023 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3P39023 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL3P39023 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3P39023 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3P39023 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3P39023 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3P39023 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3P39023 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL3P39023 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL3P39023 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3P39023 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3P39023 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3P39023 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3P39023 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL3P39023 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3P39023 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3P39023 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3P39023 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3P39023 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL3P39023 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL3P39023 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3P39023 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3P39023 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3P39023 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3P39023 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3P39023 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL3P39023 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3P39023 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3P39023 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3P39023 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3P39023 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3P39023 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3P39023 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL3P39023 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL3P39023 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL3P39023 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3P39023 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3P39023 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3P39023 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3P39023 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3P39023 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3P39023 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3P39023 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3P39023 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3P39023 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3P39023 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3P39023 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3P39023 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms