Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR2AP28223 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR2AP28223 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR2AP28223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR2AP28223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms