Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF28P17035 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF28P17035 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF28P17035 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms