Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYNP07948 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNP07948 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNP07948 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNP07948 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNP07948 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNP07948 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNP07948 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYNP07948 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYNP07948 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LYNP07948 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYNP07948 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYNP07948 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LYNP07948 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYNP07948 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYNP07948 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYNP07948 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYNP07948 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYNP07948 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYNP07948 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LYNP07948 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYNP07948 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYNP07948 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYNP07948 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNP07948 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNP07948 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNP07948 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYNP07948 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYNP07948 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYNP07948 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LYNP07948 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYNP07948 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LYNP07948 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYNP07948 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYNP07948 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYNP07948 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYNP07948 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYNP07948 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNP07948 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNP07948 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNP07948 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNP07948 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNP07948 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYNP07948 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYNP07948 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYNP07948 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYNP07948 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYNP07948 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNP07948 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNP07948 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNP07948 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNP07948 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNP07948 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNP07948 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYNP07948 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYNP07948 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYNP07948 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LYNP07948 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNP07948 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNP07948 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNP07948 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNP07948 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNP07948 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNP07948 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNP07948 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNP07948 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNP07948 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNP07948 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNP07948 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNP07948 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNP07948 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYNP07948 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYNP07948 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNP07948 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNP07948 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNP07948 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNP07948 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNP07948 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNP07948 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNP07948 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNP07948 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNP07948 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYNP07948 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYNP07948 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNP07948 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms