Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf47O95873 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf47O95873 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms