Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LTN1O94822 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTN1O94822 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTN1O94822 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTN1O94822 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTN1O94822 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTN1O94822 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTN1O94822 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTN1O94822 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTN1O94822 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTN1O94822 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTN1O94822 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTN1O94822 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTN1O94822 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTN1O94822 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTN1O94822 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTN1O94822 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LTN1O94822 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTN1O94822 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTN1O94822 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LTN1O94822 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LTN1O94822 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LTN1O94822 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTN1O94822 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTN1O94822 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTN1O94822 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTN1O94822 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTN1O94822 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTN1O94822 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LTN1O94822 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTN1O94822 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTN1O94822 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTN1O94822 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTN1O94822 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTN1O94822 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTN1O94822 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTN1O94822 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTN1O94822 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LTN1O94822 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LTN1O94822 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LTN1O94822 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LTN1O94822 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LTN1O94822 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LTN1O94822 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LTN1O94822 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LTN1O94822 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LTN1O94822 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTN1O94822 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTN1O94822 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LTN1O94822 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTN1O94822 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTN1O94822 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTN1O94822 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LTN1O94822 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LTN1O94822 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTN1O94822 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTN1O94822 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTN1O94822 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTN1O94822 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTN1O94822 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTN1O94822 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LTN1O94822 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LTN1O94822 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
LTN1O94822 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LTN1O94822 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTN1O94822 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTN1O94822 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTN1O94822 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LTN1O94822 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTN1O94822 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LTN1O94822 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTN1O94822 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTN1O94822 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTN1O94822 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTN1O94822 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTN1O94822 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTN1O94822 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTN1O94822 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTN1O94822 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTN1O94822 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
LTN1O94822 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTN1O94822 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTN1O94822 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LTN1O94822 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LTN1O94822 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTN1O94822 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTN1O94822 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTN1O94822 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTN1O94822 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTN1O94822 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTN1O94822 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LTN1O94822 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LTN1O94822 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms