Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD6O60522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD6O60522 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD6O60522 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD6O60522 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms