Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA2O43464 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTRA2O43464 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA2O43464 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA2O43464 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms