Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAD1O00515 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAD1O00515 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAD1O00515 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAD1O00515 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAD1O00515 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAD1O00515 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAD1O00515 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAD1O00515 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAD1O00515 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAD1O00515 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAD1O00515 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAD1O00515 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LAD1O00515 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAD1O00515 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LAD1O00515 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LAD1O00515 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAD1O00515 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAD1O00515 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAD1O00515 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAD1O00515 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAD1O00515 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAD1O00515 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAD1O00515 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAD1O00515 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAD1O00515 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAD1O00515 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAD1O00515 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAD1O00515 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAD1O00515 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAD1O00515 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAD1O00515 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAD1O00515 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAD1O00515 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAD1O00515 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAD1O00515 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAD1O00515 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAD1O00515 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAD1O00515 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAD1O00515 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAD1O00515 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAD1O00515 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAD1O00515 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAD1O00515 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAD1O00515 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAD1O00515 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAD1O00515 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAD1O00515 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAD1O00515 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAD1O00515 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAD1O00515 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAD1O00515 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAD1O00515 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAD1O00515 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAD1O00515 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAD1O00515 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAD1O00515 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAD1O00515 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAD1O00515 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAD1O00515 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAD1O00515 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAD1O00515 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAD1O00515 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms