Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
LAD1O00515 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAD1O00515 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
LAD1O00515 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LAD1O00515 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LAD1O00515 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LAD1O00515 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LAD1O00515 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAD1O00515 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LAD1O00515 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LAD1O00515 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAD1O00515 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAD1O00515 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
LAD1O00515 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LAD1O00515 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAD1O00515 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LAD1O00515 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LAD1O00515 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LAD1O00515 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAD1O00515 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LAD1O00515 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LAD1O00515 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LAD1O00515 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAD1O00515 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAD1O00515 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAD1O00515 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAD1O00515 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAD1O00515 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAD1O00515 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAD1O00515 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LAD1O00515 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LAD1O00515 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LAD1O00515 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LAD1O00515 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LAD1O00515 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAD1O00515 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LAD1O00515 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAD1O00515 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LAD1O00515 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAD1O00515 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LAD1O00515 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LAD1O00515 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LAD1O00515 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LAD1O00515 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LAD1O00515 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAD1O00515 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAD1O00515 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAD1O00515 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LAD1O00515 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAD1O00515 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAD1O00515 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAD1O00515 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAD1O00515 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAD1O00515 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAD1O00515 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAD1O00515 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LAD1O00515 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LAD1O00515 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAD1O00515 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LAD1O00515 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAD1O00515 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAD1O00515 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LAD1O00515 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAD1O00515 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LAD1O00515 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAD1O00515 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAD1O00515 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAD1O00515 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LAD1O00515 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAD1O00515 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAD1O00515 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAD1O00515 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAD1O00515 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAD1O00515 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAD1O00515 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAD1O00515 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAD1O00515 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAD1O00515 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAD1O00515 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAD1O00515 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAD1O00515 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAD1O00515 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAD1O00515 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
LAD1O00515 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAD1O00515 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAD1O00515 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LAD1O00515 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LAD1O00515 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LAD1O00515 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LAD1O00515 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LAD1O00515 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAD1O00515 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAD1O00515 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAD1O00515 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAD1O00515 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAD1O00515 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAD1O00515 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAD1O00515 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
LAD1O00515 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAD1O00515 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms