Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H7C0C1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H7C0C1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H7C0C1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C0C1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C0C1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C0C1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C0C1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C0C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C0C1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C0C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C0C1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H7C0C1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H7C0C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C0C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C0C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C0C1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C0C1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C0C1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C0C1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C0C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C0C1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C0C1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C0C1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C0C1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C0C1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C0C1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C0C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C0C1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C0C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C0C1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C0C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C0C1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C0C1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C0C1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0C1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0C1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0C1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0C1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0C1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0C1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H7C0C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C0C1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C0C1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C0C1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0C1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0C1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C0C1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C0C1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C0C1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C0C1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C0C1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C0C1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C0C1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0C1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C0C1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C0C1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0C1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0C1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0C1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0C1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0C1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0C1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0C1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0C1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C0C1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C0C1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C0C1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C0C1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C0C1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms