Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQF6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BQF6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BQF6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQF6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BQF6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQF6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQF6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQF6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BQF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQF6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQF6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQF6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQF6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQF6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQF6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BQF6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BQF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQF6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQF6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQF6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQF6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQF6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQF6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQF6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQF6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQF6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQF6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQF6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQF6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQF6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQF6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQF6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQF6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQF6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQF6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQF6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQF6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQF6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQF6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQF6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQF6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQF6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQF6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQF6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQF6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQF6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQF6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQF6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQF6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQF6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQF6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQF6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms