Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF25A6NGN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF25A6NGN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF25A6NGN4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF25A6NGN4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms