Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L4A6NEF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA6L4A6NEF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA6L4A6NEF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms