Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms