Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP69A5D8W1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP69A5D8W1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP69A5D8W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 583.2 ms