Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL4A3BPQ9Y5P4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A3BPQ9Y5P4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A3BPQ9Y5P4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms