Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX4Q9Y2E6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX4Q9Y2E6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX4Q9Y2E6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX4Q9Y2E6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX4Q9Y2E6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX4Q9Y2E6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTX4Q9Y2E6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX4Q9Y2E6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms