Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2LQ9UL33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAPPC2LQ9UL33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms