Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTNAP2Q9UHC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP2Q9UHC6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNTNAP2Q9UHC6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms