Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
WDR35Q9P2L0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR35Q9P2L0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR35Q9P2L0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR35Q9P2L0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR35Q9P2L0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR35Q9P2L0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR35Q9P2L0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR35Q9P2L0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms