Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX43Q9NXZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX43Q9NXZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX43Q9NXZ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX43Q9NXZ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms