Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARVAQ9NVD7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARVAQ9NVD7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PARVAQ9NVD7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms