Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOMER2Q9NSB8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOMER2Q9NSB8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOMER2Q9NSB8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms