Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM8Q9NQV8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM8Q9NQV8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM8Q9NQV8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms