Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4CQ9C0C4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms