Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR1Q9BXC0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR1Q9BXC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCAR1Q9BXC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCAR1Q9BXC0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms