Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPAS2Q99743 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS2Q99743 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS2Q99743 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms