Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGLYRP2Q96PD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGLYRP2Q96PD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGLYRP2Q96PD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGLYRP2Q96PD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms