Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACAP3Q96P50 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACAP3Q96P50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ACAP3Q96P50 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACAP3Q96P50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACAP3Q96P50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACAP3Q96P50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACAP3Q96P50 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACAP3Q96P50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms