Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC43Q96MW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC43Q96MW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC43Q96MW1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC43Q96MW1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms