Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP205Q92621 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP205Q92621 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP205Q92621 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms