Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JPH3Q8WXH2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
JPH3Q8WXH2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
JPH3Q8WXH2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
JPH3Q8WXH2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms